Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms