Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trappc10Q3TLI0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms