Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Usp39Q3TIX9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp39Q3TIX9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms