Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf2f1Q3THK3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms