Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1aQ2LKU9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms