Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ptcd3Q14C51 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptcd3Q14C51 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms