Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Traf3ip1Q149C2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms