Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc39dQ0VF76 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms