Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp2b3Q0VF55 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp2b3Q0VF55 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms