Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zc3h18Q0P678 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms