Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms