Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tgm3Q08189 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tgm3Q08189 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tgm3Q08189 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tgm3Q08189 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tgm3Q08189 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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