Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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F13bQ07968 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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F13bQ07968 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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F13bQ07968 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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F13bQ07968 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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F13bQ07968 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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F13bQ07968 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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F13bQ07968 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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F13bQ07968 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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F13bQ07968 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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F13bQ07968 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F13bQ07968 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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F13bQ07968 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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F13bQ07968 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms