Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col9a2Q07643 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col9a2Q07643 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms