Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gdf3Q07104 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms