Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ccl7Q03366 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms