Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Pax5Q02650 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms