Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp39Q02525 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp39Q02525 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp39Q02525 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp39Q02525 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp39Q02525 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp39Q02525 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp39Q02525 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Zfp39Q02525 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms