Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms