Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top2aQ01320 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms