Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms