Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pax8Q00288 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms