Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms