Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nucb2P81117 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nucb2P81117 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms