Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Otx2P80206 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms