Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf3P70671 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf3P70671 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Irf3P70671 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf3P70671 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf3P70671 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Irf3P70671 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf3P70671 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf3P70671 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf3P70671 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf3P70671 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irf3P70671 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf3P70671 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf3P70671 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf3P70671 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irf3P70671 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irf3P70671 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms