Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd13P70217 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms