Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf5P70191 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms