Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PrkcbP68404 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PrkcbP68404 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcbP68404 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcbP68404 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcbP68404 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcbP68404 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcbP68404 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcbP68404 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PrkcbP68404 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PrkcbP68404 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PrkcbP68404 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PrkcbP68404 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms