Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Snrpd3P62320 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms