Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms