Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms