Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dpf3P58269 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Dpf3P58269 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms