Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpa1P57784 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpa1P57784 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms