Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rrp1P56183 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rrp1P56183 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms