Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NcanP55066 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NcanP55066 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NcanP55066 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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