Protein–RNA interactions for Protein: P50636

Rnf19a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19aP50636 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnf19aP50636 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnf19aP50636 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms