Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdhaP50136 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms