Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CtshP49935 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CtshP49935 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtshP49935 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms