Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ercc3P49135 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms