Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnni3P48787 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms