Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpl5P47962 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl5P47962 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl5P47962 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl5P47962 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl5P47962 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl5P47962 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl5P47962 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl5P47962 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpl5P47962 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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