Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gli1P47806 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gli1P47806 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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