Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ercc5P35689 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ercc5P35689 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms