Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdh15P33146 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Cdh15P33146 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdh15P33146 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms