Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc11P31313 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc11P31313 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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