Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd28P31041 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd28P31041 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cd28P31041 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms