Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

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Length 739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Vcam1P29533 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vcam1P29533 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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