Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprmP28828 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprmP28828 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprmP28828 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms