Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RxraP28700 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RxraP28700 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RxraP28700 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RxraP28700 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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